أعلن نجله خالد عرفات عبر صفحته على موقع التواصل الاجتماعي وفاة والده. وستقام الجنازة من مسجد السيدة نفيسة بعد صلاة العصر.وكتب نجل الراحل هشام عرفات على صفحته: “إنا لله وإنا إليه راجعون. انتقل إلى رحمة الله والدي والوزير الحبيب الدكتور هشام عرفات مهدي وزير النقل الأسبق. وستقام صلاة الجنازة غدا الخميس بعد صلاة العصر من مسجد السيدة نفيسة والدفن في مقابر العائلة. اللهمّ ثبته عند السؤال، واجعل مثواه الفردوس الأعلى.
تولى الدكتور هشام عرفات وزير النقل المصري الأسبق، وزارة النقل في التعديلات الوزارية لوزارة شريف إسماعيل في فبراير 2017، واستمر في منصبه في وزارة مصطفى مدبولي حتى استقال من منصبه في 27 فبراير 2019. عقب حادث قطار محطة رمسيس. وأشرف خلال فترة عمله على وزارة النقل. المشروع القومي للطرق والذي أحدث طفرة ملحوظة في البنية التحتية للطرق في مصر.